Kraj Kwitnącej Wiśni posiada doskonale rozwinięty transport lotniczy, który z uwagi na wyspiarski charakter kraju ma zasadnicze znaczenie w międzynarodowym ruchu pasażerskim. Po Stanach Zjednoczonych Japonia jest drugim krajem na świecie o największych przewozach ładunków i osób.

Główne międzynarodowe porty lotnicze to:

• Lotnisko Tokio Narita (NRT)
• Lotnisko Kansai w Osace (KIX)
• Lotnisko Chūbu w Nagoi (NGO)

Największym japońskim oraz czwartym największym na świecie jest lotnisko Haneda w Tokio, które swą wysoką pozycję utrzymuje pomimo tego, że obsługuje jedynie loty krajowe

• Lotnisko Haneda w Tokio (HND)

Inne japońskie lotniska to:

• Lotnisko Nagoja (NKM)
• Lotnisko Sapporo Chitose (CTS)

Do głównych japońskich przewoźników lotniczych należą Japan Airlines (JAL) oraz All Nippon Airways (ANA), ponadto w przewozach krajowych istotne znaczenie odgrywają linie lotnicze Skymark Airlines czy Skynet Asia Airways.