Baza noclegowa w Guayaquil jest bardzo dobrze rozwinięta. Turyści chcący zaoszczędzić pieniądze mogą skorzystać z zakwaterowania w pokojach wieloosobowych nawet za 10 dolarów za noc. Nocleg w hotelu średniej klasy to wydatek rzędu 17 dolarów. Guayaquil ma do zaoferowania także hotele luksusowe, w tym Hilton i Sheraton. Ceny w nich, jak łatwo się domyśleć, są dalekie od ideału dla przeciętnego turysty. Standard hoteli nie odbiega od norm europejskich, pokoje są czyste i wygodne, w większości przypadków można też zamówić wyżywienie. Zaleca się oczywiście wcześniejszą rezerwację miejsc.