Ostatnią chyba rzeczą, jaka może niepokoić turystę podczas pobytu w Bazylei, są noclegi. Jako jedno z głównych europejskich centrów konferencyjnych (i najważniejszych w Szwajcarii) miasto ma godną pozazdroszczenia bazę noclegową i doskonałe przygotowanie turystyczne. Ważne jest tylko, aby pamiętać o rezerwacji noclegów podczas odbywających się w mieście festiwali. Naprawdę trudno jest wówczas znaleźć pokój w rozsądnej cenie bez wcześniejszego rozeznania. 

Standard hoteli jest bardzo wysoki. Hotelarze starają się zapewniać gościom wszystko, co tylko możliwe. Niczym niezwykłym nie są minibary czy telewizory plazmowe w pokojach. Niestety, wszystko to jest związane z wysokimi cenami. Większość hoteli należy do dużych i drogich światowych sieci, warto więc poszukać odmiany. Najtańsze noclegi w wieloosobowych pokojach w hostelach kosztują co najmniej 30 franków za noc. Średnia klasa to co najmniej 100 franków za noc, a noclegi w ekskluzywnych hotelach zaczynają się od 250 franków.